個別元本は合算し算出されますが、課税取得単価はNISA口座以外の口座での保有分の単価となります。
NISA口座内で生じた譲渡益は非課税となる一方、その損失額をNISA以外の口座で生じた配当等と損益通算することや繰越控除することはできません。